Wykrywanie mutacji APC w kale DNA u pacjentów z guzami jelita grubego

Nieinwazyjne metody wykrywania guzów jelita grubego mogą potencjalnie zmniejszyć chorobowość i umieralność z powodu tej choroby. Mutacje w genie gruczolakowatej polipowatości coli (APC), które inicjują nowotwory jelita grubego, teoretycznie zapewniają optymalny marker do wykrywania guzów jelita grubego. Celem naszych badań było określenie możliwości wykrywania mutacji APC w DNA kałowym za pomocą nowo opracowanych metod.
Metody
Oczyściliśmy DNA z rutynowo pobieranych próbek kału i przeszukiwaliśmy pod kątem mutacji APC przy użyciu nowego podejścia zwanego cyfrowym skróceniem białka. Wiele różnych mutacji można potencjalnie zidentyfikować w delikatny i specyficzny sposób za pomocą tej techniki.
Wyniki
Próbki kału od 28 pacjentów z nierozciętymi rakami jelita grubego, 18 pacjentów z gruczołami o średnicy co najmniej cm i 28 pacjentów z chorobą nowotworową bez choroby nowotworowej badano. Mutacje APC zidentyfikowano u 26 z 46 pacjentów z nowotworami (57%, przedział ufności 95%, 41 do 71%) iu żadnego z 28 pacjentów kontrolnych (0%, przedział ufności 95%, 0 do 12%; 0,001). U pacjentów z pozytywnymi testami zmutowane geny APC stanowiły od 0,4 do 14,1 procent wszystkich genów APC w kale.
Wnioski APC
mutacje można wykryć w DNA kałowym u pacjentów ze stosunkowo wczesnymi guzami jelita grubego. To studium wykonalności sugeruje nowe podejście do wczesnego wykrywania nowotworów jelita grubego.
Wprowadzenie
Opracowano kilka strategii wczesnego wykrywania guzów jelita grubego. Kolonoskopia, sigmoidoskopia i lewatywy z użyciem baru są bardzo specyficznymi i czułymi testami na obecność neoplazji 1-4, ale są inwazyjne i ograniczone przez dostępność ekspertów w zakresie procedur i przestrzegania przez pacjenta. Badania na obecność krwi utajonej w kale pokazano w niektórych badaniach mających na celu zmniejszenie częstości występowania i zachorowalności i umieralności na raka jelita grubego. 7-11 Testy na krew utajoną w kale są nieinwazyjne i niezwykle użyteczne, ale niewystarczająco czułe lub specyficzne dla nowotworu. 12-15 Ponadto, niektóre okulistyczne badania krwi w kale wymagać od pacjentów zmiany diety przed badaniem lub wymagać wielu testów, potencjalnie zmniejszających zgodność .5,16,17 Istnieje zatem potrzeba opracowania nowych testów przesiewowych, które pokonają te przeszkody.
Jedna z najbardziej obiecujących klas nowych markerów diagnostycznych składa się z mutacji w onkogenach i genach supresorowych.18 Ponieważ mutacje te są bezpośrednio odpowiedzialne za rozwój nowotworów, mają wyraźną przewagę nad pośrednimi markerami, takimi jak krew utajona w kale. Kilka grup zgłosiło, że mutacje w genach związanych z nowotworem można wykryć w kale pacjentów z rakiem jelita grubego.19-33 Jednak wrażliwość i specyficzność tych podejść została ograniczona przez utrudnienia techniczne lub niskie częstotliwości wykrywalnych mutacji w jakimkolwiek specyficzny gen.
Celem naszych badań było opracowanie testu opartego na pojedynczym genie, który ułatwiłby wykrywanie guzów jelita grubego we wczesnym stadium choroby. Optymalnym genem do takich badań jest gen gruczolakowatej polipowatości coli (APC), 34,35, ponieważ mutacje w tym genie na ogół inicjują neoplazję jelita grubego.36 Inne mutacje występują tylko w późniejszych stadiach nowotworu jelita grubego, takich jak te w p53, 37 lub może być obecny w nienowotworowych, hiperproliferacyjnych komórkach, takich jak te w c-Ki-ras.38-40. Jednak wykrycie mutacji w APC stanowi niezwykle trudne wyzwanie techniczne
[patrz też: kulturystyka forum, octan glatirameru, charakteropatia ]
[patrz też: jaka dieta na redukcje, octan glatirameru, afekt patologiczny ]