Biegunka przyczyną śmierci u dzieci w wieku <5 lat cz. 4

width=250Wykrywanie Cryptosporidiosis

Pojedyncze, świeże próbki kału pobierano od dzieci każdego miesiąca (comiesięczny nadzór) i podczas epizodów biegunki. Przeprowadzono zmodyfikowany protokół ekstrakcji DNA kału Qiagen, obejmujący inkubację w temperaturze 95 ° C i 3-minutowy etap szklanej perełki (Qiagen, Valencia, Kalifornia). Wszystkie próbki kału badano na obecność Cryptosporidium za pomocą testu ilościowej reakcji łańcuchowej polimerazy (qPCR) zmodyfikowanego z Liu i wsp. Zastosowano próg cyklu równy 40. Startery i sondy pan-Cryptosporidium celują w gen 18S u wielu gatunków, o których wiadomo, że zarażają ludzi. Wszystkie próbki pozytywne dla Cryptosporidium zostały następnie ocenione pod kątem identyfikacji gatunków za pomocą opisanego powyżej testu qPCR w skali Lib13 dla C. hominis i C. parvum oraz nowego testu qPCR C. meleagridis.

Definicje

Biegunkę definiowano jako ≥3 luźne stolce w ciągu 24 godzin, jak podaje opiekun dziecka. Zakażenie Cryptosporidium zdefiniowano jako wykrywanie DNA Cryptosporidium przez qPCR z kału. Próbki zostały zgrupowane w pojedynczą infekcję, jeśli wystąpiły w ciągu 65 dni od poprzedniej pozytywnej próbki opartej na genotypowaniu gp60 podzbioru próbek (≤ 65 dni: 93% zgodności,> 65 dni: 33% zgodności). Fenotyp zakażenia Cryptosporidium (biegunka lub subkliniczny) był oparty na objawach w momencie początkowej próbki kału Cryptosporidium (stolca biegunkowego vs comiesięcznego nadzoru). Cząsteczki sprawcze przypisano na podstawie wyników próbek kału uzyskanych podczas infekcji.
[przypisy: dieta na kaloryfer, eskulap łomża, olx susz ]